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Resume

Jean-Marie Favreau CNR-IMATI
Istituto per la Matematica Applicata e le Tecnologie Informatiche
Consiglio Nazionale delle Ricerche
Via De Marini, 6 - 16149 Genova (Italy)

Email: Jean-Marie.Favreau@ens-cachan.org
Jabber: jmtrivial@amessage.de
Phone:+39 010 6475562
Web: http://jmfavreau.info/

Current position

Since November 2009: post-doctoral research associate at the Institute for Applied Mathematics and Information Technologies – Italian National Research Council (Genova, Italy), with Michela Spagnuolo.

Education

  • 2009: PhD in Computer Science, Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand, France
    Thesis title: "Tools for tiling surfaces"
    Advisor: Vincent Barra
    Mention très honorable
  • 2005: Master 2 STS Recherche, Université de Rennes 1 (ENS Cachan antenne Bretagne), France
    Rank: 3rd (distinction: très bien)
    • Theorical part: Computer science and telecommunication
    • Master 2 internship:
      Atlas probabiliste des frontières fonctionnelles des aires visuelles
      Managed by Christian Barillot (VisAGeS team) and Michel Dojat (INSERM U594).
  • Summer 2004: admitted at the entrance exam of the ENS de Cachan;
  • 2004: Maîtrise d'Informatique at the Faculté des Sciences et Techniques, Nantes, France (Options: artificial intelligence, constrainte programming, semi-formal modelization).
  • 2003:
    • Maîtrise de Mathématiques at the Faculté des Sciences et Techniques, Nantes, France (Options: distributions and EDP, algebraic topology);
    • Licence d'Informatique at the Faculté des Sciences et Techniques, Nantes, France;
  • 2002: Licence de Mathématiques Fondamentales at the Faculté des Sciences et Techniques, Nantes, France (Options: scientific computation, probabilities);
  • 2001: DEUG MIAS Mathématiques at the Faculté des Sciences et Techniques, Nantes, France;
  • 1999: Scientific A-levels (spanish option, speciality: mathematics), distinction: assez bien.

Publications

  • Gris F., Favreau J.-M., Acosta O., Barra V., Salvado O. " A combined voxel and surface based method for topology correction of brain surfaces", SPIE medical imaging, 13 - 18 February 2010 San Diego, California, USA
  • Favreau J.-M., Marzais T., Gérard Y., Barra V., "Tiling Surfaces with M-Tiles : a Topological Framework with Applications", Computational Geometry : Theory and Applications (submitted)
  • Favreau, J.-M., Barra V. "Conformal Flattening of the Cortical Surface using a Topological and Geometrical Cutting", SEECCM, South-East European Conference on Computational Mechanics, Island of Rhodes, Greece, 2009
  • Favreau, J.-M., Barra V. "Low-resolution Surface Mapping: a Topological and Geometrical Approach", EuroCG'09, Brussels, Belgium, 2009
  • Favreau, J.-M., Barra V. "Cutting an Organic Surface", EuroCG'09, Brussels, Belgium, 2009
  • Favreau J.-M., Hemm S, Nuti C, Coste J, Barra V, Lemaire J.J. "A Tool for Topographic Analysis of Electrode Contacts in Human Cortical Stimulation", In Proceedings of ICCV 2007, Rio de Janeiro, Brazil, 2007 (link, poster, bibtex)
  • Favreau, J.-M., Hemm S., Nuti C. "Analyse topographique de la position électrodes dans le cadre de la stimulation corticale", Journée de l'École Doctorale SPI, 2007 (fr, link)
  • Favreau J.-M., Ciofolo C., Barillot C. "Extraction et étude statistique du sillon calcarin", MAJECSTIC, 2005 (link)
  • Favreau, J.-M. "Atlas probabiliste des frontières fonctionnelles des aires visuelles", mémoire de Master 2, Université de Rennes 1, 2005 (link)
  • Bezivin J., Devedzic V., Djuric D., Favreau J.-M., Gasevic D., Jouault F. "An M3-Neutral infrastructure for bridging model engineering and ontology engineering", In Proceedings of the 1st International Conference on Interoperability of Enterprise Software and Applications, Geneva, Switzerland, 2005 (link)

Teaching

Courses

  • 2007/2008: Mathematics
    N+I: 32 hours.
  • 2007/2008 : Computer science
    Blaise Pascal University, L2 computer science/mathematics : 12 hours (introduction to image processing).
  • 2007/2008: Computer science
    ISIMA, 1st year: 12 hours of practical work (Introduction to C Programming).
  • 2007/2008: Computer science
    ISIMA, 2nd year: 16 hours of practical work (Introduction to C++ Programming).
  • 2006/2007: Graphs et optimization apply to biology
    Master 2 BioInfo: 12 hours (introduction to graph theory).

Project management

  • 2007/2008 : Intégration de la bibliothèque carbon dans CImg : affichage d'image et gestion d'événements
    Studiants: Adrien Reboisson and Romain Blei, 3rd year studiants at l'ISIMA (F2)
  • 2006/2007: Outil de gestion de références bibliographiques
    Studiants: Tarik Osswald and Vincent Naigeon, 2nd year studiants at ISIMA (F2)
  • 2006/2007: Portail pour artistes du libre
    Studiants: Bayrem Nafti and Oumar Ngaido, étudiants en 2nd year studiants at ISIMA (F3)

Responsibilities

  • 2007-2009 : représentant des doctorants du pôle Clermont au CIES de Lyon
  • 2008-2009 : représentant des doctorants du LIMOS pour l'École doctorale SPI
  • 2009 : membre élu du conseil du laboratoire LIMOS (UMR CNRS 6158)

Professional activities and internships

  • 2005-2006: Ingénieur de recherche dans l'équipe ERIM (EA 3295) située à Clermont-Ferrand. Développement d'outils de cartographie de la surface corticale du sillon central;
  • January 2005: Encadrement d'une formation aux logiciels libres en infographie, proposée par l'Olympic;
  • Summer 2004: Stage encadré par Jean Bézivin et Frédéric Jouault au LINA, Laboratoire d'Informatique de Nantes Atlantiques, pendant 2 mois; Mise en place d'un site internet utilisant Zope (The ATL home page). Étude de l'espace technique des ontologies, et proposition d'un modèle en 3 niveaux pour illustrer la conjecture des trois niveaux dans le cadre de l'ingénierie des modèles. Réalisation de modèles en TCS et de transformations en ATL.
  • 2003-2004: Aide-webmaster au laboratoire LINA de la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes. Réalisation et maintenance de plusieurs sites internet du laboratoire.
  • 2003-2004: TER maîtrise d'informatique: Expression de focus sur des ontologies pour traiter les demandes des utilisateurs dans un système multi-agent dédié à la recherche d'informations (encadré par P. Lamarre); Focus Home Page).
  • Summer 2003: Stage encadré par Philippe Lamarre et Sylvie Cazalens à l'IRIN, Laboratoire d'Informatique de la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes, pendant 6 semaines; Étude de la notion de focus sur une ontologie, et implémentation d'un prototype en Java de calcul de proximité entre concepts.
  • 2002-2003: TER maîtrise de mathématiques: Analyse et réalisation d'un encodeur/décodeur JPEG en langage C (encadré par J.P. Guillement).

Hobbies and association activities