Jean-Marie Favreau CNR-IMATI
Istituto per la Matematica Applicata e le Tecnologie Informatiche
Consiglio Nazionale delle Ricerche
Via De Marini, 6 - 16149 Genova (Italie)

Courriel : Jean-Marie.Favreau@ens-cachan.org
Jabber : jmtrivial@amessage.de
Téléphone : +39 010 6475562
Site web : http://jmfavreau.info/

Études en cours

Depuis november 2009 : post-doctorant à l'Institute for Applied Mathematics and Information Technologies – Italian National Research Council (Genova, Italie), avec Michela Spagnuolo.

Diplômes

• 2009 : Thèse de doctorat en science informatique, Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand, France
  Titre de la thèse : « Outils pour le pavage de surfaces »
  Directeur : Vincent Barra
  Mention très honorable
• 2005 : Master 2 STS Recherche, Université de Rennes 1 (ENS Cachan antenne Bretagne)
  Classement : 3e (mention très bien)
  • Partie théorique : filière Informatique et télécommunication
  • Stage de Master 2 :
    Atlas probabiliste des frontières fonctionnelles des aires visuelles
    Stage encadré par Christian Barillot (de l'équipe VisAGeS) et Michel Dojat (INSERM U594).
• Été 2004 : admis au concours d'entrée en 3^e année à l'ENS de Cachan;
• 2004 : Maîtrise d'Informatique à la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes (Options : intelligence artificielle, programmation par contraintes, techniques de modélisation semi-formelles).
• 2003 :
  • Maîtrise de Mathématiques à la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes (Options : distributions et EDP, topologie algèbrique);
  • Licence d'Informatique à la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes;
• 2002 : Licence de Mathématiques Fondamentales à la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes (Options : calcul scientifique, probabilités);
• 2001 : DEUG MIAS Mathématiques à la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes;
• 1999 : Baccalauréat scientifique (option espagnol, spécialité mathématiques), mention assez bien.

Publications

• Gris F., Favreau J.-M., Acosta O., Barra V., Salvado O. " A combined voxel and surface based method for topology correction of brain surfaces", SPIE medical imaging, 13 - 18 February 2010 San Diego, California, USA
• Favreau J.-M., Marzais T., Gérard Y., Barra V., "Tiling Surfaces with M-Tiles : a Topological Framework with Applications", Computational Geometry : Theory and Applications (soumis)
• Favreau, J.-M., Barra V. "Conformal Flattening of the Cortical Surface using a Topological and Geometrical Cutting", SEECCM, South-East European Conference on Computational Mechanics, Island of Rhodes, Greece, 2009
• Favreau, J.-M., Barra V. "Low-resolution Surface Mapping: a Topological and Geometrical Approach", EuroCG'09, Brussels, Belgium, 2009
• Favreau, J.-M., Barra V. "Cutting an Organic Surface", EuroCG'09, Brussels, Belgium, 2009
• Favreau J.-M., Hemm S., Nuti C., Coste J., Barra V, Lemaire J-.J. "A Tool for Topographic Analysis of Electrode Contacts in Human Cortical Stimulation", In Proceedings of ICCV 2007, Rio de Janeiro, Brazil, 2007 (lien, poster, bibtex)
• Favreau, J.-M., Hemm S., Nuti C. "Analyse topographique de la position électrodes dans le cadre de la stimulation corticale", Journée de l'École Doctorale SPI, 2007 (fr, lien)
• Favreau J.-M., Ciofolo C., Barillot C. "Extraction et étude statistique du sillon calcarin", MAJECSTIC, 2005 (lien)
• Favreau, J.-M. "Atlas probabiliste des frontières fonctionnelles des aires visuelles", mémoire de Master 2, Université de Rennes 1, 2005 (lien)
• Bezivin J., Devedzic V., Djuric D., Favreau J.-M., Gasevic D., Jouault F. "An M3-Neutral infrastructure for bridging model engineering and ontology engineering", In Proceedings of the 1st International Conference on Interoperability of Enterprise Software and Applications, Geneva, Switzerland, 2005 (lien)

Enseignement

Cours

• 2007/2008 : Mathématiques
  N+I : 32 heures de cours intégrés (remise à niveau mathématiques destiné à des étudiants étrangers arrivant en France pour faire des études d'ingénierie).
• 2007/2008 : Informatique
  Université Blaise Pascal, L2 informatique/mathématique : 12 heures de cours (Introduction au traitement d'image).
• 2007/2008 : Informatique
  ISIMA, 1^e année : 12 heures de travaux pratiques (introduction à la programmation en langage C).
• 2007/2008 : Informatique
  ISIMA, 2^e année : 16 heures de travaux pratiques (introduction à la programmation en langage C++).
• 2006/2007 : Graphes et Optimisation appliqués à la biologie
  Master 2 BioInfo : 12 heures de cours intégrés (introduction à la théorie des graphes).

Encadrement de projet

• 2007/2008 : Intégration de la bibliothèque carbon dans CImg : affichage d'image et gestion d'événements
  Étudiants : Adrien Reboisson et Romain Blei, étudiants en 3^ème année à l'ISIMA (filière F2)
• 2006/2007 : Outil de gestion de références bibliographiques
  Étudiants : Tarik Osswald et Vincent Naigeon, étudiants en 2^ème année à l'ISIMA (filière F2)
• 2006/2007 : Portail pour artistes du libre
  Étudiants : Bayrem Nafti et Oumar Ngaido, étudiants en 2^ème année à l'ISIMA (filière F3)

Responsabilités

• 2007-2009 : représentant des doctorants du pôle Clermont au CIES de Lyon ;
• 2008-2009 : représentant des doctorants du LIMOS pour l'École doctorale SPI ;
• 2009 : membre élu au conseil du laboratoire LIMOS (UMR CNRS 6158).

Stages et emplois

• Année 2005-2006 : Ingénieur de recherche dans l'équipe ERIM (EA 3295) située à Clermont-Ferrand. Développement d'outils de cartographie de la surface corticale du sillon central ;
• Janvier 2005 : Encadrement d'une formation aux logiciels libres en infographie, proposée par l'Olympic ;
• Été 2004 : Stage encadré par Jean Bézivin et Frédéric Jouault au LINA, Laboratoire d'Informatique de Nantes Atlantiques, pendant 2 mois; Mise en place d'un site internet utilisant Zope (The ATL home page). Étude de l'espace technique des ontologies, et proposition d'un modèle en 3 niveaux pour illustrer la conjecture des trois niveaux dans le cadre de l'ingénierie des modèles. Réalisation de modèles en TCS et de transformations en ATL.
• Année 2003-2004 : Aide-webmaster au laboratoire LINA de la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes. Réalisation et maintenance de plusieurs sites internet du laboratoire.
• Année 2003-2004 : TER maîtrise d'informatique: Expression de focus sur des ontologies pour traiter les demandes des utilisateurs dans un système multi-agent dédié à la recherche d'informations (encadré par P. Lamarre); Focus Home Page).
• Été 2003 : Stage encadré par Philippe Lamarre et Sylvie Cazalens à l'IRIN, Laboratoire d'Informatique de la Faculté des Sciences et Techniques de Nantes, pendant 6 semaines; Étude de la notion de focus sur une ontologie, et implémentation d'un prototype en Java de calcul de proximité entre concepts.
• Année 2002-2003 : TER maîtrise de mathématiques: Analyse et réalisation d'un encodeur/décodeur JPEG en langage C (encadré par J.P. Guillement).

Engagements associatifs et hoobies

• Ardent défenseur des logiciels libres, participation active aux LUG Linux-Nantes, Gulliver puis Linux Arverne depuis plusieurs années. Modérateur sur le site agendadulibre.org. Membre fondateur de l'association Libre Attitude.
• Utilisateur de GNU/Linux depuis 1999;
• Membre de l'APRIL;
• Passionné d'infographie (quelques réalisations en ligne).
• Co-responsable du thème Sciences, recherche, médecine aux RMLL 2007.
• Janvier 2007: conférence à l'ADASTA pour LinuxArverne: « présentation du Logiciel Libre ».